分子生物学软件应用 刘旭光,张杰　编著 北京大学医学出版社【正版可开发票】 fb2 免费 lrf 下载 kindle azw3 pdf 阿里云

本书共包括四个部分。部分介绍了计算机软件在核酸序列分析中的应用，主要包括序列格式转换、结构功能分析、克隆与引物设计等；第二部分介绍了计算机软件在蛋白质序列分析中的应用，主要包括理化性质分析、结构预测、三维分子显示等；第三部分介绍了计算机软件在序列比对中的应用，包括BLAST、本地BLAST、多序列两两比对与进化树分析等；第四部分介绍了计算机软件在文献管理与引用中的应用，主要包括文献管理、参考文献的引用等。本书主要面向生物、医学专业的研究生、高年级本科生，以及相关专业的其他研究人员。

部分 核酸序列分析

　1 序列检索与格式转换

　　1.1 序列检索

　　1.2 序列格式简介

　　1.3 格式转换

　2 一级结构分析

　　2.1 组成成分分析

　　2.2 重复序列

　　2.3 序列变换

　3 克隆

　　3.1 酶切位点查找

　　3.2 模拟电泳

　　3.3 电泳图像分析

　　3.4 质粒绘图

　　3.5 克隆策略与过程显示

　4 引物设计

　　4.1 引物设计的基本原则

　　4.2 引物设计与分析

　　4.3 高通量引物与探针设计

　5 测序拼装

　　5.1 测序图分析

　　5.2 测序拼装

　6 DNA功能分析

　　6.1 ORF查找与翻译

　　6.2 Motif查找

　7 RNA二级结构预测

　　7.1 RNAstructure

　　7.2 RNAdraw

　　7.3 DNAstar

第二部分 蛋白质序列分析

1 理化性质分析

1.1 蛋白酶酶切特性

　　1.2 滴定曲线与等电点

　　1.3 亲水性和疏水性

　　1.4 电荷密度

　2 二级结构预测

　　2.1 DNAstar

　　2.2 Vector NTI Advance

　　2.3 ANTHEPROT

　3 其他特殊局部结构分析

　　3.1 膜蛋白的跨膜螺旋

　　3.2 信号肽

　　3.3 卷曲螺旋

　　3.4 抗原决定簇

　4 三维分子显示

　　4.1 RasMol

　　4.2 Vector NTI Advance

　　4.3 Cn3D

第三部分 序列比对及进化树

　1 BLAST

　　1.1 BLAST简介

　　1.2 BLAST、实践

　　1.3 BLAST、高级选项

　2 本地BLAKI

　3 多序列之间的两两比对与进化树分析

　　3.1 C1ustalX

　　3.2 DNAstar

　　3.3 Vector NTI Advance

　　3.4 PLYLIP

第四部分 文献管理与引用

　1 文献管理

　　1.1 Reference Manager

　　1.2 EndINote

　　1.3 NoteExpress

　　1.4全文查找

　2 在Word中引用文献

　　2.1 Reference Manager

　　2.2 EndNote

　　2.3 NoteExpress

附录1 软件简介

附录2 参考文献

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书籍介绍

《分子生物学软件应用》共包括四个部分。第一部分介绍了计算机软件在核酸序列分析中的应用，主要包括序列格式转换、结构功能分析、克隆与引物设计等；第二部分介绍了计算机软件在蛋白质序列分析中的应用，主要包括理化性质分析、结构预测、三维分子显示等；第三部分介绍了计算机软件在序列比对中的应用，包括BLAST、本地BLAST、多序列两两比对与进化树分析等；第四部分介绍了计算机软件在文献管理与引用中的应用，主要包括文献管理、参考文献的引用等。